Unidad
INTRODUCCIÓN
La Unidad de Genómica esta integrada en los Servicios Centrales de Apoyo a la Investigación ( SCAI) de la Universidad de Córdoba.
El objetivo principal es prestar soporte cientifico técnico en el área de la genómica a toda la comunidad universitaria que lo necesite, así como a aquellos usuarios externos que lo requieran ya que cuenta con equipamiento de última generación y personal cualificado para llevar a cabo las prestaciones solicitadas.
Nuestras principales aplicaciones son la secuenciación Sanger, el genotipado de ADN, los microarrays de ADN y la secuenciación masiva o NGs.
Equipos
EQUIPOS PRINCIPALES
- Equipo de electroforesis capilar, con 16 capilares.
Disponible para las aplicaciones como secuenciación de ADN Sanger y análisis de fragmentos.
- Equipo de electroforesis capilar, con 16 capilares.
Disponible para las aplicaciones como secuenciación de ADN Sanger y análisis de fragmentos.
- Equipo de PCR a tiempo real. Posibilidad de trabajar en placas de 96 o en tiras de tubos.
Aplicaciones disponibles: cuantificación absoluta, cuantificación relativa, discriminación alélica y expresión génica, ensayos Plus/Minus, entre otros.
- Robot de impresión en soporte sólido.
- Escáner de arrays de ADN y proteínas.
- Sistema automatizado de electroforesis para el análisis de calidad y/o cantidad de muestras de ADN, ARN y proteínas en chips específicos.
- Horno de Hibridación para arrays con rotor y cámaras específicas.
- Horno de Hibridación para arrays comerciales Affymetrix con rotor y cámaras específicas.
- Escáner de arrays comerciales de Affymetrix.
- Equipo de RT-PCR a gran escala.
Puede trabajar en formato OpenArray, placas de 384 pocillos y TaqMan Arrays Cards.
Aplicaciones disponibles: cuantificación absoluta/relativa, Expresión Génica, MiRNAs y Genotipado, entre otras.
- Sistema de secuenciación de última generación (NGS) basado en semiconductores.
Aplicaciones disponibles: Metagenómica (16S), RNA-Seq, AmpliSeq, amplicones personalizados entre otros.
- Sistema de secuenciación de última generación (NGS) basado en semiconductores.
Aplicaciones disponibles: Metagenómica (16S), RNA-Seq, AmpliSeq, amplicones personalizados entre otros.
- Escáner de arrays comerciales.
Proporciona un escaneo de fluorescencia inducida por láser.
- Fluorímetro para la cuantificación de ADN y ARN. Disponemos de dos modos de cuantificación; alta sensibilidad , para muestras de muy baja concentración, y de amplio rango.
Técnicas y Aplicaciones
TÉCNICAS Y APLICACIONES
- Secuenciación Sanger de ADN sobre distinto material genético
- Secuenciación Masiva
- Genotipado a gran escala.
- Análisis de Fragmentos de ADN (Genotipado de ADN)
- SNPs (Kit SnapShot, SNPlex)
- Expresión/Cuantificación Génica
- Discriminación Alélica mediante sondas Taq-Man
- Detección y cuantificación de microorganismos y OGMs,
- Detección de SNPs , mutaciones y polimorfismos
- Control de calidad de ADN, ARN y proteínas
- Evaluación de la fidelidad de fragmentos amplificados
- Impresión de Microarrays y Macroarrays de ADN y proteínas
- Marcaje de sondas para microarrays y control de calidad de las mismas
- Hibridación, lavado y lectura de microarrays de diferentes plataformas
- Normalización y análisis de datos de microarrays
Personal
PERSONAL
Responsables:
Ubicación: Edificio Ramón y Cajal. Torre Este. 3ª Planta. Campus de Rabanales. Córdoba (España)
Teléfono: 957 218 587
E-mail: Esta dirección de correo electrónico está siendo protegida contra los robots de spam. Necesita tener JavaScript habilitado para poder verlo.
Docs
MANUALES Y FORMULARIOS
Guía de Usuario de la Unidad:
Acceso al portal de Solicitud de Servicios:
Solicitud de Servicios LIMS-SCAI
Enlaces
ENLACES RELACIONADOS CON LA UNIDAD DE GENÓMICA
- Enlaces sobre Secuenciación
- NCBI
- BLAST
- 4peaks (Libre para MacOS X 10.2 en adelante)
- FinchTV (Libre para Linux, PCs, y MACs)
- Sequence Scanner Software v1.0
- Análisis de Fragmentos y otras aplicaciones de Applied Biosystems.
- Enlaces sobre MicroArrays
- Agilent Technologies (Genomics Products)
- Plataforma de Affymetrix de Microarrays
- Otros enlaces:
- Plataforma Bioinformática de Andalucía (Málaga)
- Centro Nacional de Genotipado (CEGEN)